有的区域为扭转发展不平衡状况,以整体推进战略实施为理由,提前大兴土木,多方集资筹资,造成了资源的浪费,占用了大量的建设资本,占用了大量的粮田,耕地锐减、粮食安全问题加剧,1997年至2003年的7年中,我国耕地减少1亿亩(666.7亿平方米),到2003年底全国有6015个开发区,规划面积达到3.54万平方公里,而共和国建国54年来全国城镇建设用地的总面积仅为3.25万平方公里。国家每年进口粮食在500亿公斤以上,据粮食专家估计,到2010年我国将有2亿吨的粮食缺口,需要大量的外汇储备,即使有了足额的外汇,也不可能完全由国际市场来解决。这增加了大量的外汇储备和中间费用的开支,经济和社会效益并不突出,出现发展成本与效益的巨大反差。
有的区域以工业兴县和扩大就业为理由,大搞地方保护主义政策,以牺牲环境为代价,上马高污染、高能耗、低效益的工业项目,甚至把国外及东部地区淘汰了的工业机械设备以高价甩给西部,上当受骗、造成污染等,为今后治理环境遗留了高昂的环境治理成本。